自動進樣器分為吸入式自動進樣器，推入式自動進樣器和整體樣品環自動進樣器三種列別。
對于吸入式自動進樣器來說，樣品是被注射器產生的吸力吸入樣品環，這種設計的自動進樣器在早期因其簡單可靠而非常流行，但是后來隨著另外兩種設計的出現而逐漸衰退。吸入式自動進樣器注射器連在廢液排出口，采樣針和相應的管路連接在進樣口，針插入樣品瓶中，接著注射器回吸知道樣品*充滿樣品環，圓形密封墊旋轉將樣品進樣。
吸入式自動進樣器的設計較為簡潔，只有采樣針沿一個軸上下運動，通過旋轉樣品盤將所需樣品瓶置于針下，然后根據需求開始進樣。而吸入式自動進樣器的缺點則是會有樣品的浪費，因為樣品在進入樣品環之前首先必須充滿采樣針和相連的管路，所以就造成了一定程度上的樣品浪費。
推入式自動進樣器的設計也較為常見，這種技術和手動進樣極為相似。注射器移動到樣品瓶，吸入預定量的樣品，再移動至進樣口，將樣品注入樣品環。這種設計方式需要的樣品量遠小于吸入式設計，并且注射器的吸取和排出都是在步進馬達下控制完成的，可以達到很高的精密度和準確度，正常情況下進樣的結果偏差都在0.5%以下。同時，推入式自動進樣器也包含了吸入式自動進樣器所沒有的一些功能，比如任意樣品序列、多溶劑清洗功能、智能程序化進樣等，滿足了實驗室分析的不同進樣需求。
整體樣品環自動進樣器，比較適用于樣品量有限的痕量分析，基本上沒有樣品的浪費。其運行過程相對于以上兩種較為復雜。整體樣品環自動進樣器的整個進樣過程中，樣品只存在于清洗過的樣品環內，所以全部樣品都被進樣，不會造成浪費，大進樣體積取決于樣品環容量。
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